Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc160Q3UYG1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms