Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn13Q3UW68 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Capn13Q3UW68 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms