Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb2Q3UUV9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms