Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim15Q3UTD9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms