Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm5460Q3UQ97 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5460Q3UQ97 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5460Q3UQ97 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5460Q3UQ97 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5460Q3UQ97 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm5460Q3UQ97 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm5460Q3UQ97 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm5460Q3UQ97 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5460Q3UQ97 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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