Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
D13Ertd608eQ3UPR8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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