Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog7Q3UM29 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms