Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ell2Q3UKU1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ell2Q3UKU1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ell2Q3UKU1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms