Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edc4Q3UJB9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edc4Q3UJB9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms