Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc58Q3UGP9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc58Q3UGP9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms