Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atxn7l3bQ3UD01 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn7l3bQ3UD01 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms