Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip13Q3UA06 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms