Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q3U6N9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q3U6N9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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