Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf149Q3U2C5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms