Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U1D9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U1D9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U1D9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U1D9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U1D9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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