Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem35bQ3U0Y2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem35bQ3U0Y2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms