Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Palb2Q3U0P1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Palb2Q3U0P1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms