Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc9Q3U0M1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms