Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hace1Q3U0D9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms