Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hbq1bQ3U0A6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbq1bQ3U0A6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbq1bQ3U0A6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbq1bQ3U0A6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbq1bQ3U0A6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hbq1bQ3U0A6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbq1bQ3U0A6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbq1bQ3U0A6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbq1bQ3U0A6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbq1bQ3U0A6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbq1bQ3U0A6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hbq1bQ3U0A6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbq1bQ3U0A6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms