Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms