Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxw18Q3TSA9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms