Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp39Q3TIX9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp39Q3TIX9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp39Q3TIX9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp39Q3TIX9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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