Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc13Q3TIR1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc13Q3TIR1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms