Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afvQ3THW5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2afvQ3THW5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms