Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms