Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem248Q3TBN1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem248Q3TBN1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms