Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnnm3Q32NY4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms