Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtl9Q32KG4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl9Q32KG4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl9Q32KG4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl9Q32KG4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl9Q32KG4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl9Q32KG4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl9Q32KG4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl9Q32KG4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtl9Q32KG4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms