Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms