Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Samd11Q1RNF8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms