Protein–RNA interactions for Protein: Q14B98

Fam109b, Sesquipedalian-2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam109bQ14B98 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Fam109bQ14B98 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Fam109bQ14B98 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Fam109bQ14B98 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Fam109bQ14B98 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Fam109bQ14B98 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Fam109bQ14B98 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Fam109bQ14B98 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Fam109bQ14B98 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Fam109bQ14B98 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Fam109bQ14B98 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Fam109bQ14B98 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Fam109bQ14B98 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam109bQ14B98 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms