Protein–RNA interactions for Protein: Q148W8

Dusp27, Inactive dual specificity phosphatase 27, mousemouse

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Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp27Q148W8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp27Q148W8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp27Q148W8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp27Q148W8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Dusp27Q148W8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp27Q148W8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp27Q148W8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Dusp27Q148W8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp27Q148W8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dusp27Q148W8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Dusp27Q148W8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Dusp27Q148W8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Dusp27Q148W8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Dusp27Q148W8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms