Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VgfQ0VGU4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms