Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne7Q0VE82 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne7Q0VE82 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms