Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Pglyrp4Q0VB07 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pglyrp4Q0VB07 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pglyrp4Q0VB07 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pglyrp4Q0VB07 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pglyrp4Q0VB07 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pglyrp4Q0VB07 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Pglyrp4Q0VB07 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pglyrp4Q0VB07 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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