Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Neurl1bQ0MW30 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms