Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pate4Q09098 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pate4Q09098 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms