Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc4Q08624 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc4Q08624 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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