Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgm3Q08189 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms