Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cnn1Q08091 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cnn1Q08091 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms