Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou6f1Q07916 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms