Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Col9a2Q07643 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms