Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cab39Q06138 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cab39Q06138 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms