Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Caprin2Q05A80 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms