Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprgQ05909 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprgQ05909 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms