Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hspg2Q05793 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hspg2Q05793 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms