Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox8Q04886 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms