Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smarcad1Q04692 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms