Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd1Q04519 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms